বিগত ২০২১-২২ অর্থবছরে রাজশাহী বিশ্ববিদ্যালয়ের (রাবি) আটটি খাতে এককভাবে প্রায় ৫৮ কোটি এবং সমন্বিত অন্যান্য খাতে প্রায় ১১৩ কোটি টাকার অডিট আপত্তি জানানো হয়েছে। বিশ্ববিদ্যালয় মঞ্জুরি কমিশন ও ২৫টি সরকারি বিশ্ববিদ্যালয় নিয়ে প্রকাশিত শিক্ষা অডিট প্রতিবেদনে এ আপত্তি জানায় দেশের সর্বোচ্চ অডিট প্রতিষ্ঠান মহাহিসাব নিরীক্ষক ও নিয়ন্ত্রকের  (সিএজি) কার্যালয়। এ ব্যাপারে বিশ্ববিদ্যালয়ের হিসাব পরিচালক অধ্যাপক শেখ শামসুল আরেফিন বলেন, অডিট আপত্তি একটি নিয়মিত প্রক্রিয়া। এটা কোনো অনিয়ম নয় বরং পদ্ধতিগত অমিল। প্রতি বছরই সিএজি কর্তৃপক্ষ বিভিন্ন আপত্তি জানায়। সেগুলোর জবাব দিয়ে নিষ্পত্তিও করা হয়। তাছাড়া ১১৩ কোটি টাকার অডিট আপত্তি এক অর্থবছরের নয় বরং বিগত বছরের ধারাবাহিক আপত্তির সমন্বিত রূপ। জানতে চাইলে বিশ্ববিদ্যালয়ের উপ-উপাচার্য অধ্যাপক সুলতান-উল-ইসলাম বলেন, একটি বৃহৎ প্রতিষ্ঠান চালাতে কিছু বিষয়ে অসংগতি হবে এটাই স্বাভাবিক। তবে ব্যাপক হারে দুর্নীতি হচ্ছে এমনটা না।