মিসর ও সিরিয়ায় আড়াই শত বছরের মামলুক বংশের রাজত্বের অবসান হয়। উপরন্তু গাজী সালাহউদ্দীনের আমল হতে রাজকীয় নগরী হিসেবে কায়রো যে মর্যাদা লাভ করে তা বিলুপ্ত হয়ে একটি প্রাদেশিক রাজধানীতে রূপান্তরিত হয়। সেলিম মিসরকে তুর্কি সাম্রাজ্যের অন্তর্ভুক্ত করলেও এর যথাযথ ব্যবস্থা মামলুকদের ওপরই ন্যস্ত ছিল এবং তুর্কি সরকার কর্তৃক নিযুক্ত একজন পাশার দায়িত্বে ছিল সব অর্জিত মিসর ও সিরিয়া প্রদেশের প্রশাসনিক ব্যবস্থা। এভারসলে যথার্থই বলেন, মিসর বিজয়ে পবিত্র মক্কা ও মদিনাসহ অধিকাংশ অঞ্চলের কর্তৃত্ব তুর্কিদের হস্তে অর্পিত হয়। মক্কা ও মদিনা আটোমান সাম্রাজ্যের অন্তর্ভুক্তই হলো না বরং সুলতান সেলিম কায়রো হতে ক্রীড়নক আব্বাসীয় খলিফা আল-মুতাওয়াক্কিলকে কস্টান্টিনোপলে নিয়ে আসেন। খলিফা সুলতানের ওপর খিলাফতের সব প্রতীক চিহ্ন, ক্ষমতা ও মর্যাদা হস্তান্তর করতে বাধ্য হন এবং সেলিমের পরবর্তী সব তুর্কি সুলতান নিজেদের খলিফা বলে অভিহিত করেন এবং মক্কা-মদিনা রক্ষণাবেক্ষণকারীরূপে চিহ্নিত হন।