দৃষ্টিনন্দন চিনি মসজিদটি ১৮৬৩ সালে সৈয়দপুরে প্রতিষ্ঠিত হয়। মসজিদের মুসল্লিরা বলেন, সৈয়দপুর হচ্ছে  একটি প্রাচীন জনপদ। তারা লোকমুখে শুনেছেন এই জনপদের পাশ ঘেঁষে সরমঙ্গলা নামে একটি নদী প্রবাহিত হতো।

১৮৭০ সালে সৈয়দপুরে আসাম-বেঙ্গল রেলওয়ের বৃহত্তম রেলওয়ে কারখানা গড়ে ওঠে। তখন চলছিল ব্রিটিশ ঔপনিবেশিক শাসনামল। কারখানা প্রতিষ্ঠার অনেক আগে সৈয়দপুর শহরের ইসলামবাগ এলাকায় টিন ও শন দিয়ে চিনি মসজিদটি গড়ে ওঠে।  মসজিদটির প্রতিষ্ঠাতা ছিলেন এলাকার ধনাঢ্য ব্যক্তি হাজি বাকের আলী ও হাজি মক্কু। তারা সিদ্ধান্ত নেন ইসলামবাগে একটি মসজিদ গড়ার। মসজিদটিতে দিন দিন মুসল্লিদের সংখ্যা বাড়তে থাকে। ফলে কিছুদিনের মধ্যে দোচালা টিনের ঘরে রূপান্তর করা হয় মসজিদটিকে।

চিনি মসজিদ কমিটির সভাপতি হিটলার চৌধুরী বলেন, দৃষ্টিনন্দন চিনি মসজিদ গড়ে তুলতে এর নেপথ্যে রয়েছে অনেক ইতিহাস। মসজিদ ঘিরে এলাকায় মুসলমানের সংখ্যা দিন দিন বাড়তে থাকে। এ অবস্থায় মসজিদের পরিসর বাড়ানোর প্রয়োজনীয়তা দেখা দেয়। এলাকার বাসিন্দা হাজি আবদুল করিম নিজ হাতে একটি নকশা তৈরি করেন। ১৯২০ সালে ওই নকশা অনুযায়ী চিনি মসজিদ গড়ে তোলার উদ্যোগ নেওয়া হয়। এলাকাবাসীর দেওয়া চাঁদায় কলকাতা থেকে আনা হয় ২৪৩টি শংকর মর্মর পাথর।

এ ছাড়াও বগুড়ার একটি সিরামিক কারখানার মালিক বিনামূল্যে ২৫ টন ভাঙা কাপ-পিরিচের টুকরা সৈয়দপুরে পাঠিয়ে দেন মসজিদ নির্মাণের জন্য। মসজিদটি নির্মাণে দায়িত্ব পড়ে হিন্দু রাজমিস্ত্রি শঙ্ঘ রায়ের ওপর। তাকে সহযোগিতা করতে নামেন শত শত নারী ও পুরুষ।