হোয়াটসঅ্যাপের নিরাপত্তার দিকটা খেয়াল রাখতে হয় ব্যবহারকারীদের। এখন আর ব্যবহারকারীদের পাসওয়ার্ড বা প্যাটার্ন মনে রাখতে হবে না। ফিঙ্গারপ্রিন্ট বা ফেস আইডি দিলেই কাজ হয়ে যাবে। ফোন আনলক করার জন্য ব্যবহৃত বায়োমেট্রিক মেথড ব্যবহার করেই এনক্রিপ্টেড ব্যাকআপ অ্যাক্সেস অথবা রি-স্টোর করা যাবে। অ্যান্ড্রয়েড সংস্করণ ২.২৪.১৮.১৩-এর জন্য সর্বশেষ হোয়াটসঅ্যাপ বিটাতে পাস-কি ব্যবহার করে ব্যবহারকারীরা নিজেদের চ্যাট ব্যাকআপ এনক্রিপ্ট করতে পারবেন। পাস-কি হলো ডিজিটাল পরিচয়পত্র। যা ট্র্যাডিশনাল পাসওয়ার্ডের পরিবর্তে ফিঙ্গারপ্রিন্ট অথবা ফেসিয়াল রেকগনিশনের মতো বায়োমেট্রিক ডাটা ব্যবহার করবে। বিটা হাইলাইটসে এই নতুন পাস-কি এনক্রিপশন ফিচারটি প্রথম লক্ষ্য করেছে ওয়েবিটাইনফো। মূলত ইউজার ডাটা সিকিউরিটি শক্তিশালী করার জন্য এমনিতেই কাজ করছে সংশ্লিষ্ট সংস্থা। আর এই নয়া ফিচার তারই অংশ।

বর্তমানে ব্যাকআপের জন্য অ্যান্ড-টু-অ্যান্ড এনক্রিপশনের সুবিধা দেয় হোয়াটসঅ্যাপ। ফলে একটি কাস্টম পাসওয়ার্ড অথবা ৬৪ ডিজিট এনক্রিপশন কি-এর মাধ্যমে ইউজারদের ব্যাকআপ ডেটা সুরক্ষিত থাকে।